MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 10658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011981	AACG	2	8	214376	214383	50 %	0 %	25 %	25 %	222102606
3502	NC_011981	AAT	2	6	214511	214516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102607
3503	NC_011981	CCA	2	6	214570	214575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102607
3504	NC_011981	TCC	2	6	214774	214779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102607
3505	NC_011981	GGC	2	6	214787	214792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102607
3506	NC_011981	ACA	2	6	214813	214818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102607
3507	NC_011981	GCC	2	6	214836	214841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102607
3508	NC_011981	ACA	2	6	214861	214866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102607
3509	NC_011981	CAT	2	6	214886	214891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102607
3510	NC_011981	CCA	2	6	215105	215110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102607
3511	NC_011981	TCGGCA	2	12	215122	215133	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222102607
3512	NC_011981	ACG	2	6	215137	215142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102607
3513	NC_011981	GCC	2	6	215154	215159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102607
3514	NC_011981	TTC	2	6	215176	215181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102607
3515	NC_011981	CCA	2	6	215243	215248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102607
3516	NC_011981	CTTC	2	8	215285	215292	0 %	50 %	0 %	50 %	222102607
3517	NC_011981	CCG	3	9	215293	215301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102607
3518	NC_011981	GAC	2	6	215304	215309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102607
3519	NC_011981	GTG	2	6	215365	215370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102607
3520	NC_011981	ACC	2	6	215503	215508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102607
3521	NC_011981	CAGC	2	8	215657	215664	25 %	0 %	25 %	50 %	222102607
3522	NC_011981	GGC	2	6	215706	215711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102607
3523	NC_011981	GCC	2	6	215735	215740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102607
3524	NC_011981	TCG	2	6	215749	215754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102607
3525	NC_011981	CAT	2	6	215780	215785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102607
3526	NC_011981	TCACA	2	10	215795	215804	40 %	20 %	0 %	40 %	222102607
3527	NC_011981	GGC	2	6	215805	215810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102607
3528	NC_011981	TTG	2	6	215966	215971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102607
3529	NC_011981	GAC	2	6	216013	216018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102608
3530	NC_011981	T	6	6	216033	216038	0 %	100 %	0 %	0 %	222102608
3531	NC_011981	GCA	2	6	216156	216161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102608
3532	NC_011981	CG	3	6	216175	216180	0 %	0 %	50 %	50 %	222102608
3533	NC_011981	TTC	2	6	216194	216199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102608
3534	NC_011981	CG	3	6	216234	216239	0 %	0 %	50 %	50 %	222102608
3535	NC_011981	GAA	2	6	216286	216291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102608
3536	NC_011981	GTC	2	6	216304	216309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102608
3537	NC_011981	GAAGGT	2	12	216351	216362	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	222102608
3538	NC_011981	CAC	2	6	216442	216447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102608
3539	NC_011981	GGC	2	6	216490	216495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102608
3540	NC_011981	GAC	2	6	216557	216562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102608
3541	NC_011981	GCA	2	6	216593	216598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102608
3542	NC_011981	GAT	2	6	216643	216648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102608
3543	NC_011981	CCG	2	6	216740	216745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102608
3544	NC_011981	CTTCG	2	10	216763	216772	0 %	40 %	20 %	40 %	222102608
3545	NC_011981	CGG	2	6	216789	216794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102608
3546	NC_011981	CCG	2	6	216840	216845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102608
3547	NC_011981	ATG	2	6	216869	216874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102608
3548	NC_011981	ACG	2	6	216991	216996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102609
3549	NC_011981	CG	3	6	217009	217014	0 %	0 %	50 %	50 %	222102609
3550	NC_011981	CGT	2	6	217034	217039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102609
3551	NC_011981	CATG	2	8	217067	217074	25 %	25 %	25 %	25 %	222102609
3552	NC_011981	GATC	2	8	217118	217125	25 %	25 %	25 %	25 %	222102609
3553	NC_011981	AGC	2	6	217126	217131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102609
3554	NC_011981	GAT	2	6	217176	217181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102609
3555	NC_011981	GTT	2	6	217194	217199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102609
3556	NC_011981	CTCGC	2	10	217234	217243	0 %	20 %	20 %	60 %	222102609
3557	NC_011981	CGG	2	6	217316	217321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102609
3558	NC_011981	ATC	2	6	217327	217332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102609
3559	NC_011981	CAA	2	6	217337	217342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102609
3560	NC_011981	GAA	2	6	217344	217349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102609
3561	NC_011981	TTG	2	6	217393	217398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102609
3562	NC_011981	CCTTCC	2	12	217417	217428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102609
3563	NC_011981	ATC	2	6	217545	217550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102609
3564	NC_011981	TGAAA	2	10	217976	217985	60 %	20 %	20 %	0 %	222102610
3565	NC_011981	ACG	2	6	218005	218010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102610
3566	NC_011981	CCG	2	6	218120	218125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102610
3567	NC_011981	CTT	2	6	218207	218212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102610
3568	NC_011981	GAT	2	6	218225	218230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102610
3569	NC_011981	TCGG	2	8	218242	218249	0 %	25 %	50 %	25 %	222102610
3570	NC_011981	AC	3	6	218296	218301	50 %	0 %	0 %	50 %	222102610
3571	NC_011981	CAT	2	6	218375	218380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102610
3572	NC_011981	TCT	2	6	218426	218431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102610
3573	NC_011981	CTT	2	6	218459	218464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102610
3574	NC_011981	ATG	2	6	218476	218481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102610
3575	NC_011981	GCA	2	6	218486	218491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102610
3576	NC_011981	CAT	2	6	218514	218519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102610
3577	NC_011981	ATG	2	6	218548	218553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102610
3578	NC_011981	GA	3	6	218599	218604	50 %	0 %	50 %	0 %	222102610
3579	NC_011981	TGT	2	6	218618	218623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102610
3580	NC_011981	GAT	2	6	218774	218779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102611
3581	NC_011981	TGA	2	6	218784	218789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102611
3582	NC_011981	CGTGG	2	10	218795	218804	0 %	20 %	60 %	20 %	222102611
3583	NC_011981	TCG	2	6	218892	218897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102611
3584	NC_011981	GCGA	2	8	218945	218952	25 %	0 %	50 %	25 %	222102611
3585	NC_011981	ATG	2	6	218968	218973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102611
3586	NC_011981	CGAT	2	8	219131	219138	25 %	25 %	25 %	25 %	222102612
3587	NC_011981	AAC	2	6	219336	219341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102613
3588	NC_011981	ATG	2	6	219360	219365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102613
3589	NC_011981	GAGC	2	8	219366	219373	25 %	0 %	50 %	25 %	222102613
3590	NC_011981	GC	3	6	219372	219377	0 %	0 %	50 %	50 %	222102613
3591	NC_011981	GAAATC	2	12	219404	219415	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	222102613
3592	NC_011981	GAT	2	6	219533	219538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102613
3593	NC_011981	CGAT	2	8	219543	219550	25 %	25 %	25 %	25 %	222102613
3594	NC_011981	TTG	2	6	219606	219611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102613
3595	NC_011981	GC	3	6	219728	219733	0 %	0 %	50 %	50 %	222102613
3596	NC_011981	CATG	2	8	219756	219763	25 %	25 %	25 %	25 %	222102613
3597	NC_011981	TCG	2	6	219810	219815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102613
3598	NC_011981	TGCT	2	8	220020	220027	0 %	50 %	25 %	25 %	222102613
3599	NC_011981	GCC	3	9	220035	220043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102613
3600	NC_011981	CCG	2	6	220143	220148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102613
3601	NC_011981	TGAG	2	8	220194	220201	25 %	25 %	50 %	0 %	222102613
3602	NC_011981	GGT	2	6	220229	220234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102613
3603	NC_011981	ATG	2	6	220254	220259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102613
3604	NC_011981	CAG	2	6	220310	220315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102614
3605	NC_011981	TGC	2	6	220396	220401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102614
3606	NC_011981	ATC	2	6	220418	220423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102614
3607	NC_011981	GC	3	6	220445	220450	0 %	0 %	50 %	50 %	222102614
3608	NC_011981	TGG	2	6	220459	220464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102614
3609	NC_011981	CAT	2	6	220474	220479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102614
3610	NC_011981	TCCA	2	8	220581	220588	25 %	25 %	0 %	50 %	222102614
3611	NC_011981	ATC	2	6	220611	220616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102614
3612	NC_011981	GCC	2	6	220665	220670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102614
3613	NC_011981	AAT	2	6	220800	220805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102614
3614	NC_011981	GCG	2	6	220812	220817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102614
3615	NC_011981	ATC	2	6	220868	220873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102614
3616	NC_011981	CAT	2	6	221002	221007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102614
3617	NC_011981	CCA	2	6	221008	221013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102614
3618	NC_011981	CGG	2	6	221122	221127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102614
3619	NC_011981	GTG	2	6	221166	221171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102614
3620	NC_011981	GC	3	6	221184	221189	0 %	0 %	50 %	50 %	222102614
3621	NC_011981	GCC	2	6	221240	221245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102615
3622	NC_011981	TGC	2	6	221252	221257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102615
3623	NC_011981	TCT	2	6	221327	221332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102615
3624	NC_011981	TGA	2	6	221354	221359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102615
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3626	NC_011981	GCC	2	6	221431	221436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102615
3627	NC_011981	TGCC	2	8	221517	221524	0 %	25 %	25 %	50 %	222102615
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3634	NC_011981	C	6	6	221865	221870	0 %	0 %	0 %	100 %	222102615
3635	NC_011981	CCAGT	2	10	222043	222052	20 %	20 %	20 %	40 %	222102615
3636	NC_011981	CCG	2	6	222162	222167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102615
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3642	NC_011981	CCG	3	9	222437	222445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102615
3643	NC_011981	TGA	2	6	222529	222534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102616
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3651	NC_011981	GCCC	2	8	222853	222860	0 %	0 %	25 %	75 %	222102616
3652	NC_011981	A	6	6	222891	222896	100 %	0 %	0 %	0 %	222102616
3653	NC_011981	CCGCAA	2	12	222901	222912	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	222102616
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3730	NC_011981	GACA	2	8	226396	226403	50 %	0 %	25 %	25 %	222102619
3731	NC_011981	CAT	2	6	226414	226419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102619
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3858	NC_011981	TGCTC	2	10	233157	233166	0 %	40 %	20 %	40 %	222102622
3859	NC_011981	CAGCG	2	10	233253	233262	20 %	0 %	40 %	40 %	222102622
3860	NC_011981	GTC	2	6	233468	233473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102623
3861	NC_011981	GC	3	6	233514	233519	0 %	0 %	50 %	50 %	222102623
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3863	NC_011981	CCA	2	6	233573	233578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102623
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3984	NC_011981	CGGCG	2	10	240773	240782	0 %	0 %	60 %	40 %	222102631
3985	NC_011981	ACG	2	6	240861	240866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102631
3986	NC_011981	TCAG	2	8	240879	240886	25 %	25 %	25 %	25 %	222102631
3987	NC_011981	GAT	2	6	240987	240992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102631
3988	NC_011981	GTG	2	6	241041	241046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102631
3989	NC_011981	ATCG	2	8	241155	241162	25 %	25 %	25 %	25 %	222102631
3990	NC_011981	TCTG	2	8	241256	241263	0 %	50 %	25 %	25 %	222102631
3991	NC_011981	TGG	2	6	241280	241285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102631
3992	NC_011981	GC	3	6	241337	241342	0 %	0 %	50 %	50 %	222102631
3993	NC_011981	GCTT	2	8	241427	241434	0 %	50 %	25 %	25 %	222102631
3994	NC_011981	GCC	2	6	241458	241463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102631
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3997	NC_011981	GAA	2	6	241563	241568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102631
3998	NC_011981	ACA	2	6	241573	241578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102631
3999	NC_011981	CCGA	2	8	241587	241594	25 %	0 %	25 %	50 %	222102631
4000	NC_011981	TCG	2	6	241608	241613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102631

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